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Thèse

Fine mapping of female fertility qtl in french dairy cattle

Slim Ben Jemaa
Résumé : L'objectif de la thèse est la cartographie fine de QTL de fertilité femelle (FF) chez les races bovines Françaises : la Prim'Holstein (PH), la Normande (NO) et la Montbéliarde (MO). La première étape du projet consiste en une primo-localisation, sur un dispositif de 78 familles, de QTL de FF dans 12 régions génomiques. Six QTL de FF ont été détectés chez la PH et deux chez la NO. La deuxième étape consiste en une cartographie des QTL détectés sur les chromosomes BTA01, BTA02, BTA03 et BTA21 sur un échantillon de 41 familles des trois races. La localisation de ces QTL a été confirmée et précisée pour les QTL détectés sur les chromosomes BTA01 et BTA03. Le QTL sur le chromosome BTA03 a été finement cartographié en utilisant 437 SNP ce qui a permis de réduire son intervalle de localisation à quelques centimorgans et de sélectionner six gènes candidats. Les régions flanquant les exons de ces six gènes ont été séquencées sur quatre pools d'ADN d'individus de phénotypes extrêmes afin de trouver des polymorphismes intéressants dans les régions séquencées qui pourront ensuite être validés sur l'ensemble du dispositif. La mise à disposition récente d'une puce de 54000 SNP situés dans tout le génome bovin a changé la stratégie de cartographie de QTL de FF. Des gènes pouvant influencer la FF ont été sélectionnés et suggérés comme étant des gènes candidats positionnels et fonctionnels responsables de la dégradation de la FF chez les bovins laitiers.
Type de document :
Thèse
Liste complète des métadonnées

https://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00005162
Contributeur : Ecole Agroparistech Connectez-vous pour contacter le contributeur
Soumis le : mercredi 27 mai 2009 - 08:00:00
Dernière modification le : mercredi 27 mai 2020 - 09:32:04
Archivage à long terme le : : vendredi 10 septembre 2010 - 13:43:08

Identifiants

  • HAL Id : pastel-00005162, version 1

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Citation

Slim Ben Jemaa. Fine mapping of female fertility qtl in french dairy cattle. Life Sciences [q-bio]. AgroParisTech, 2009. English. ⟨NNT : 2009AGPT0012⟩. ⟨pastel-00005162⟩

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