Distribution lipidique et voies métaboliques chez quatre bactéries gram-négatives hydrocarbonoclastes. Variation en fonction de la source de carbone - Archive ouverte HAL Access content directly
Theses Year : 2004

Distribution lipidique et voies métaboliques chez quatre bactéries gram-négatives hydrocarbonoclastes. Variation en fonction de la source de carbone

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Abstract

The major aims of this study was to derive information on the effect of the carbon source on the lipid composition of the hydrocarbonoclastic Gram-negative bacteria Marinobacter hydrocarbonoclasticus, Marinobacter aquaeolei, Acinetobacter calcoaceticus and Pseudomonas oleovorans, establish the metabolic pathways of hydrocarbon degradation and to have to a better knowledge on the lipopolysaccharide Β-hydroxy acids of their external membrane. The first part of the work presents a qualitative and quantitative description of unbound, OH- labile and H+ labile lipids of M. hydrocarbonoclasticus as a function of the hydrocarbon structure used for growth (normal and branched alkanes, phenyl- and cyclohexyl-alkanes and a terminal olefin). The obtained results showed that the chemical structures of the lipids strongly correlated those of the fed hydrocarbons: appearance of significant and in some cases very important proportions of fatty acids derived from the degradation of these compounds. Β-hydroxy acids of the LPS are less sensitive to the change of the hydrocarbon structure. Β-n-12:0 is always dominant, the Β-hydroxy acids derived from the hydrocarbons can be incorporation to the LPS but constituted minor compounds.
Les principaux objectifs de ce travail de recherche étaient (i) l'étude de la composition lipidique de quatre bactéries Gram-négatives hydrocarbonoclastes Marinobacter hydrocarbonoclasticus, Marinobacter aquaeolei, Acinetobacter calcoaceticus et Pseudomonas oleovorans en fonction de la source de carbone, (ii) la détermination des différents voies métaboliques de dégradation des hydrocarbures comportant une chaîne alkyle et (iii) mieux connaître la composition en Β-hydroxy acides lipopolysaccharidiques de leurs membranes extérieures. La première partie de ce travail présente une description qualitative et quantitative des lipides "non liés", labiles en milieu basique et labiles en milieu acide de M. hydrocarbonoclasticus en fonction de l'hydrocarbure (alcanes normaux et ramifiés, phényl et cyclohexyl-alcanes, et 1-alcène) utilisé comme source unique de carbone et d'énergie. Ces résultats ont montré que la structure chimique des lipides identifiés suit celle de l'hydrocarbure fourni: apparition de proportions significatives et dans certains cas très importantes d'acides gras issus de la dégradation de ces composés. Les Β-hydroxy acides des LPS sont moins sensibles au changement de la structure de l'hydrocarbure. Le n-Β-12:0 est toujours dominant alors que les Β-hydroxy acides provenant de la dégradation des hydrocarbures peuvent être incorporés aux LPS mais ne constituent que des composés mineurs. La présence d'intermédiaires métaboliques de chaque hydrocarbure dans les lipides "non liés" a permis la détermination des différents voies métaboliques de dégradation. La deuxième partie de ce travail porte sur la composition lipidique des bactéries M. aqueolei, A. calcoaceticus et P. oleovorans en fonction de la source de carbone (acétate ou alcane). Cette partie a montré le degrés de variabilité des acides gras chez les bactéries Gram-négatives M. aquaeolei et A. calcoaceticus: substitution des acides gras normaux pairs par des acides gras de même parité et même squelette que l'alcane utilisé. Chez P. oleovorans l'utilisation d'alcanes courts se manifeste aussi bien sur la distribution des acides gras membranaire que sur la composition en Β-hydroxy acides des LPS. Enfin, les Β-hydroxy acides issus des quatre bactéries étudiées sont essentiellement normaux pairs de C10 à C14 dont le composé prédominant est dépendant de l'espèce bactérienne.
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Cite

Mohamed Soltani. Distribution lipidique et voies métaboliques chez quatre bactéries gram-négatives hydrocarbonoclastes. Variation en fonction de la source de carbone. Autre. Chimie ParisTech, 2004. Français. ⟨NNT : ⟩. ⟨tel-00009276⟩
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