Protein glycosylation structural characterization : from glycomins to glycoproteomics, a powerful strategy to study gonadotropins - Archive ouverte HAL Access content directly
Theses Year : 2019

Protein glycosylation structural characterization : from glycomins to glycoproteomics, a powerful strategy to study gonadotropins

Caractérisation structurale de la glycosylation des protéines : de la glycomique à la glycoprotéomique, une stratégie utile pour l’étude des gonadotrophines

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Abstract

Polysaccharides from glycoproteins play an important part in numerous biological processes and pathologies. Their structural elucidation requires performant and sensitive tools capable of assessing the heterogeneity of such glycans. Different approaches were developed: N-glycan analysis by MALDI-TOF and LC-ESI-FTMS proteomics.Glycomics is the analysis of glycans independently of their linked-protein and can be using to obtain a glycosylation fingerprint of a protein, fluid etc. Developments of innovative sample and matrix preparation conditions, including glycan chemical modification, improved their mass spectrometry detection and fragmentation.Glycopeptide and glycoprotein analysis permits selective assessment of the glycan population across the protein hence allowing the characterization of molecular microheterogeneity of the different glycoforms. The development and integration of non-specific protease digestion and stepped-energy fragmentation produced more diverse and reliable identifications.Because of their critical role in gestation and embryo development, glycosylated gonadotropins are of major medical and veterinary interest. Combining analytical methodologies granted access to the characterization of population-specific glycosylation motifs.
La composante sucrée des glycoprotéines joue un rôle majeur dans de nombreux processus physiologiques et pathologiques. Leur analyse structurale nécessite des outils performants capables d’évaluer la forte hétérogénéité de ces glycanes. Des approches complémentaires ont été développées : l’analyse des N-glycanes par MALDI-TOF et l’approche protéomique par LC-ESI-FTMS.La glycomique consiste en l’analyse des sucres indépendamment de la protéine, pouvant livrer une empreinte globale de la glycosylation au niveau d’une protéine, d’un fluide etc… Le développement de nouvelles conditions de préparation d’échantillon et de matrice incluant la modification chimique des sucres nous a permis d’améliorer leur détection et leur fragmentation par spectrométrie de masse.La considération des glycanes comme partie des glycoprotéines et glycopeptides permet une sélectivité accrue et une caractérisation de l’hétérogénéité intramoléculaire de ces glycosylations. L’intégration de protéases aspécifiques et de fragmentation à énergie variable (SCE) nous a conduit à plus de diversité et de fiabilité dans les glycoformes identifiées.De par leur implication dans la grossesse et le développement de l’embryon, les glycohormones gonadotropes ont un fort intérêt médical et vétérinaire. La combinaison des méthodes analytiques a été entreprise dans le but de caractériser les motifs de glycosylation spécifiques à différentes populations.
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  • HAL Id : tel-02896596 , version 2

Cite

Nicolas Eskenazi. Caractérisation structurale de la glycosylation des protéines : de la glycomique à la glycoprotéomique, une stratégie utile pour l’étude des gonadotrophines. Chimie analytique. Université Paris sciences et lettres, 2019. Français. ⟨NNT : 2019PSLET032⟩. ⟨tel-02896596v2⟩
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